高昌国王被带走后，李节也没有重新任命高昌国的朝廷，反而将原本高昌国四郡十八个县四个戍的行政编制，合并为一个郡，交河郡，并以伊吾郡郡丞梁硕为郡丞领郡事。

其余诸县，合并为前庭（高昌城）、交河、始昌、柳中（今新疆鄯善西南鲁克沁）、蒲昌（白力城，今新疆鄯善）五县。

交河郡虽为高昌国郡，但无论是太守，还是县令，皆为隋人担任。甚至连军队，也为隋军收编。

至此，高昌国只剩下一个名字，只等着灭亡了。

······

黄明辽占据高昌，补全了西州缺失的一块版图。

此时西州面积地愈千里，连亘天山南北，一个伊吾郡便治理不过来。于是黄明辽将天山以北的新附之地，沙陀碛以南，直到叶河，设北庭郡，治轮台县，以李节兼任太守。而从叶河以西，直到阿拉山，车岭（今新疆博罗科努山）以北，设双河郡，治西林镇，以蒙跃为太守。

大隋在天山以北其实只将势力拓展到黄草泊，至于黄草泊以西，实际上根本管不了，这里还是西突厥的地盘。至于从叶河到黄草泊，也不过只有几个屯镇，所以这个双河郡，不过是个名头。

但是黄明辽仍然坚持设立双河郡，以为大隋在天山北麓西拓的主力。

这时李节又提议，重新对大隋在西域的据点进行划分等级。

西州总管府设立之后，一般对大城设县，驻军设镇，至于新开拓、建设的城堡也为镇，这就导致，大镇有军队数千，小镇有可能只有几十人，严重影响对各地的管辖。

于是李节建议，管民的县、乡仍依照旧例。至于有驻军的城池，依照驻军数量、城池大小、人口数量，设置军府、镇、戍、堡四级单位。

其中驻军不满百的，皆为堡，设正副堡将。

戍一级，下戍驻军一百五十人，中戍驻军三百人，上戍驻军五百人，戍设正副戍将；

镇一级，下镇驻军八百人，中镇驻军一千人，上镇驻军一千两百人，比照国中的鹰扬府，镇设镇将；

而镇之上设军府，一般多为两三千人，还有成规模的胡兵。镇、戍、堡的设置只是根据诸军的多寡，没有直接统属关系。无论是镇、戍还是堡，皆直辖于军府。

至于一些没有官军驻扎，多是百姓自发组织民兵的地方，设置屯。

如此隋军在西域的城池，多成军管，一管军，一管民，方便了守备与开拓。而如此改变，原本的镇数量大为减少，整个天山北麓，只剩下西林、轮南、咸泉、蒲类、金满等几个镇。

此时军府尚只有焉耆一地。